Το 1995 το Ίδρυμα θεσμοθέτησε ετήσιο πρόγραμμα ερευνητικών χορηγιών και εκπαιδευτικών υποτροφιών για έρευνα, σπουδές και καλλιτεχνική δημιουργία στην Ελλάδα. Το πρόγραμμα αυτό αφορά αποκλειστικά σε υποτροφίες για αλλοδαπούς, μέλη Εθνικών Ακαδημιών, πανεπιστημιακούς καθηγητές όλων των βαθμίδων, κατόχους διδακτορικού τίτλου, μεταδιδακτορικούς ερευνητές, μεταπτυχιακούς φοιτητές και υποψήφιους διδάκτορες, καλλιτέχνες και εκπαιδευτικούς δημοτικής και μέσης εκπαίδευσης, οι οποίοι διδάσκουν την ελληνική γλώσσα, την ελληνική λογοτεχνία, την ιστορία και τον ελληνικό πολιτισμό. Κατ εξαίρεση και κατά περίπτωση, το πρόγραμμα δέχεται και τους Έλληνες της διασποράς, της δεύτερης γενιάς, καθώς και τους Έλληνες μόνιμους κατοίκους εξωτερικού που φοιτούν ή εργάζονται σε αλλοδαπά πανεπιστήμια περισσότερο από δέκα ή δεκαπέντε χρόνια, αναλόγως κατηγορίας της υποτροφίας.

Απευθύνεται επίσης στους Κύπριους πολίτες που έχουν σπουδάσει και κατοικούν εκτός Ελλάδας, και είναι μέλη Εθνικών Ακαδημιών, πανεπιστημιακοί όλων των βαθμίδων – κάτοχοι διδακτορικού τίτλου, μεταδιδακτορικοί ερευνητές– και διαπρεπείς καλλιτέχνες.
Σκοπός του προγράμματος είναι η προώθηση της ελληνικής γλώσσας, της ιστορίας και του πολιτισμού στο εξωτερικό, προσβλέποντας στη δημιουργία και την ενίσχυση των δεσμών φιλίας και συνεργασίας ανάμεσα στα μέλη της αλλοδαπής ακαδημαϊκής κοινότητας και στους Έλληνες ομολόγους τους.

Η επιλoγή των υπoψηφίων για χορήγηση ερευνητικής χορηγίας ή εκπαιδευτικής υποτροφίας βασίζεται σε εισηγήσεις επιτροπών ακαδημαϊκών συμβούλων και επικυρώνεται από το διοικητικό συμβούλιο του Ιδρύματος.
Στις επιτροπές συμμετέχουν Καθηγητές Α.Ε.Ι., Ειδικοί Επιστήμονες και Αναγνωρισμένοι Καλλιτέχνες. Η συμμετoχή είναι τιμητική και η πρoσφoρά εθελoντική. Στις επιτροπές προσφέρουν τις υπηρεσίες τους, πρώην υπότροφοι του Ιδρύματος πoυ πλέον κατέχoυν θέσεις στην ακαδημαϊκή κοινότητα.

Οι επιχορηγούμενοι και οι υπότροφοι όλων των ετών λειτουργίας του προγράμματος προέρχονται από 65 χώρες: Αίγυπτo, Αλβανία, Αργεντινή, Αρμενία, Αυστραλία, Αυστρία, Βέλγιo, Βενεζουέλα, Βoσνία-Ερζεγoβίνη, Βoυλγαρία, Βραζιλία, Γαλλία, Γερμανία, Γεωργία, Γκάνα, Ελλάδα, Εσθονία, Ηνωμένο Βασίλειο, ΗΠΑ, Iαπωνία, Ινδία, Ιορδανία, Ιράν, Iρλανδία, Ισλανδία, Ισπανία, Ισραήλ, Ιταλία, Καζακστάν, Καμερούν, Καναδά, Κίνα, Κoνγκό, Κoύβα, Κρoατία, Κύπρο, Λετoνία, Λιθoυανία, Μαρόκo, Μεξικό, Μoγγoλία, Μoλδαβία, Νότια Αφρική, Νότια Κορέα, Oλλανδία, Oυγγαρία, Oυζμπεκιστάν, Oυκρανία, Oυρoυγoυάη, Πακιστάν, Περού, Πoλωνία, Πορτογαλία, Ρoυμανία, Ρωσία, Σερβία-Μαυροβούνιο, Σλοβακία, Σλoβενία, Σoυηδία, Σρί Λάνκα, Τoυρκία, Τσεχία, Τυνησία, Φινλανδία και Χιλή.

Προκειμένου να υποστηρίξει τους αλλοδαπούς υποτρόφους του, το Ίδρυμα έχει συνάψει συμβάσεις συνεργασίας και υποστήριξης με τα Ινστιτούτα Νεο¬ελληνικών Ερευνών (ΙΝΕ), Βυζαντινών Ερευνών (ΙΒΕ), Ελληνικής και Ρωμαϊκής Αρχαιότητος (ΙΕΡΑ) και του Εθνικού Κέντρου Τεκμηρίωσης (ΕΚΤ) –από το 2011- του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών (ΕΙΕ) από το 2002 εως και σήμερα, καθώς και με το Ελληνικό Ίδρυμα Ευρωπαϊκής και Εξωτερικής Πολιτικής (ΕΛΙΑΜΕΠ) για το διάστημα από το 2001 εως το 2010, οπότε και ολοκληρώθηκε η συνεργασία.
Ειδικότερα, το ΕΙΕ παραχωρεί στους αλλοδαπούς υποτρόφους συγκεκριμένο χώρο εργασίας, εξοπλισμένο με υλικοτεχνική και γραμματειακή υποστήριξη –με δαπάνες του Ιδρύματος– και προωθεί την επιστημονική συνεργασία των αλλοδαπών υποτρόφων του Ιδρύματος τόσο με τους μόνιμους όσο και με τους εξωτερικούς επιστημονικούς συνεργάτες τους. Ακόμη έχει συμφωνήσει και παρέχει στους υποτρόφους απρόσκοπτη πρόσβαση στις βιβλιοθήκες, στα αρχεία των ηλεκτρονικών τραπεζών πληροφοριών και στα αρχεία της ηλεκτρονικής τράπεζας αρθρογραφίας ημερησίου, διεθνούς και ελληνικού τύπου.

Τέλος, αναλαμβάνουν με τους επιστημονικούς συνεργάτες τους την καθοδήγηση και την παρακολούθηση της προόδου των ερευνητικών εργασιών των υποτρόφων, καθώς και τη συμμετοχή τους σε συνέδρια και ημερίδες που διοργανώνουν.

Με πρότυπο την επιτυχημένη έκδοση του Λευκώματος Ελλήνων Υποτρόφων, το Ίδρυμα εξέδωσε το 2001 το πρώτο δίγλωσσο (ελληνικά-αγγλικά) Λεύκωμα Αλλοδαπών Επιχορηγούμενων και Υποτρόφων, όπου καταγράφεται η ακαδημαϊκή, ερευνητική και επαγγελματική εξέλιξή τους.

Ο αριθμός των υποτροφιών του Ιδρύματος προς αλλοδαπούς διαφοροποιείται ανά έτος, με μέσο όρο τις 35 υποτροφίες για αλλοδαπούς ετησίως. Στα δεκαεπτά χρόνια λειτουργίας του προγράμματος (1995-2013) δόθηκαν 745 ερευνητικές χορηγίες και εκπαιδευτικές υποτροφίες για αλλοδαπούς, η συνολική δαπάνη των οποίων ανέρχεται σε 10.552.722 δολάρια ΗΠΑ.

• ΠΡΟΚΗΡΥΞΗ 19ΟΥ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ ΥΠΟΤΡΟΦΙΩΝ ΠΡΟΣ ΑΛΛΟΔΑΠΟΥΣ, ΑΚΑΔ. ΕΤΟΣ 2013/2014
• ΠΡΟΚΗΡΥΞΗ 19ΟΥ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ ΥΠΟΤΡΟΦΙΩΝ ΠΡΟΣ ΑΛΛΟΔΑΠΟΥΣ, ΑΚΑΔ. ΕΤΟΣ 2013/2014 (ΓΑΛΛΙΚΑ)
• ΣΥΧΝΕΣ ΕΡΩΤΗΣΕΙΣ / ΑΠΑΝΤΗΣΕΙΣ (FAQ)